人類Y染色體的萎縮只是為了拋棄有缺陷的基因，而且只保留了重要的基因。
人類X和Y染色體決定了後代出生時的性別。但是在過去的1.8億年裡，Y染色體已經明顯的收縮，失去了90%的基因。科學家們提出理論稱，Y染色體或許將繼續萎縮，而且未來有一天會完全消失。一些哺乳動物已經失去了它們的Y染色體，但由於性別基因能夠跳到另一個染色體上，這些動物仍然能夠產下雄性和雌性後代。因此理論上人類失去Y染色體的變化並不意味著男性末日。
但是據加利福尼亞大學的一項研究稱，Y染色體將停止丟失基因。這項研究的負責人，加利福尼亞大學環境生物學家Melissa Wilson Sayres說道：“在失去部分基因之後，Y染色體只保留了對人類功能必要的核心基因。我們預計人類Y染色體將不再失去基因。”為了證實這一推論，研究人員檢查了8位非洲男性和8位歐洲男性的Y染色體，而且發現Y染色體差異性較小，這就意味著Y染色體幾乎完全相同。
研究人員猜想，Y染色體如何變得如此相似。Wilson Sayres說道：“這或許是某種自然選擇在起作用，Y染色體是在有選擇的淨化自己。通過拋棄基因，Y染色體能夠淨化人類基因突變。”那麼X染色體為什麼沒有發生這種變化呢？在女性中，X染色體能夠與它的配對在基因突變事件中交換DNA，這就使它能修復自身並且繼續攜帶數千種健康基因。
Wilson Sayres說道：“X和Y染色體的大部分長度上都不會交換DNA，這就意味著Y染色體無法有效的修正錯誤，因此它隨著時間發展不斷分解。Y染色體只是在擺脫有缺陷的基因，現在它只保留了27個獨特的基因。”但是仍然存在另一個令人困擾的問題：“如果Y染色體不再失去任何基因，那麼基因突變在男性中是否變得更加普遍？Wilson Sayres聲稱，這種男性突變的偏斜正是她接下來要進行研究的內容。
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