本報西安4月15日電 (通訊員 王靜思 記者 劉傳書)今天,西安交通大學和華大基因召開新聞發布會,宣布“朱鹮全基因組序列圖譜繪制完成”。這是世界上完成的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列 圖譜,其對於挽救和保護朱鹮和注釋生命現像具有重要科學價值和戰略意義。
朱鹮屬於國家一級保護鳥類,是世界上最瀕危的鳥類之一,在進化中擁有獨特的地位,具有快速趨向滅絕的生命現像特征。1960年朱鹮列入“國際保 護鳥”的名單中。目前,世界上僅有陝西洋縣及其周邊地區分布著近1000只朱鹮,但他們的自然繁殖能力還很低。朱鹮基因組序列圖譜的完成為保護珍稀鳥類提 供了重要理論依據,同時對尋找瀕危物種相關的分子標記和對物種步入瀕危期預警具有重大戰略意義。
朱鹮全基因組序列圖譜繪制項目采用目前最先進全基因組鳥槍法測序(WGS)策略,使用自主研發的SOAPdenovo軟件進行拼接組裝,朱鹮基 因組大小約為1.37Gb;拼接組裝所獲得的序列Contig N50的長度為22.2kb,Scaffold N50的長度超過5.09Mb。朱鹮基因組圖譜是進行朱鹮基因組研究的基礎,通過測序及相關研究掌握朱鹮基因組信息並探索與生物進化相關的重要基因,重點 搭建數據庫及分析平台是後續朱鹮功能基因組與生態學研究的科學保障。通過該研究可以從基因角度破解朱鹮繁殖能力低下、朱鹮幼鳥的高死亡率等問題,此外,還 可以進行野生種群和培育種群基因篩選和遺傳標記研究,從而實現朱鹮疾病預警和發掘健康培育新技術。同時,該成果還可以為注釋動物滅絕這一生命現像、動植物 遺傳資源保護和開展珍稀動植物司法鑒定奠定基矗
朱鹮基因組計劃由西安交通大學和華大基因共同主持,協作組成員單位有:陝西漢中國家朱鹮保護局、陽明大學、中國鳥類學會、中國科學院、蘭州大學等,以及美國、日本、澳大利亞等國科學家。